由于期货市场不同于股票市场的交易规则、交易机制以及不能直接买入指数现货等方面的因素，实际操作中，即使是期现套利也并非是完全无风险的，以下几个方面都将影响套利的效果乃至成败。
 

 1.etf组合对指数的复制效果

 由于不能直接买入指数现货，而是通过构建etf组合来模拟指数收益，所以必然与指数存在一定的误差，这一方面是因为组合本身并非完全复制指数，导致其收益不是与指数完全相同。另一方面，所有的研究都是建立在历史数据的基础上，市场可能出现与历史差异较大的情况。
 

 2.期货套利边界估计

 在估计期货套利边界中，有一些参数是无法准确设定的，这样也会对套利造成一定的风险。对于风险承受能力较小的中小投资者而言，建议在基差或价差达到一定程度后再进行套利。
 

 3.期货到期收敛问题

 理论上讲，股指期货到期时的价格应该与当时的现货指数价格一致，也就是基差为零，但根据中金所规定，交割结算价为最后交易日指数最后两小时的算术平均价。所以存在期货不能完全收敛到现货的情况，影响套利效果。
 

 4.期货强行平仓风险

 期货实行保证金制度，如果价格向不利于投资者的方向变动，保证金不足时将被要求追加保证金，如不能按时缴足保证金，将会面临强制平仓风险。一旦发生这种情况，套利将受到巨大影响，甚至会出现失败。也正是考虑到这一点，在前述200万资金的套利策略中，我们留有相对较多的期货保证金，但仍不能保证在价格剧烈波动时有可能出现保证金不足的情况。